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迪飛學(xué)術(shù) | mNGS快速診斷吉拉爾迪嗜銅菌感染COVID-19康復(fù)患者案例報(bào)道

瀏覽數(shù)量: 0     作者: 本站編輯     發(fā)布時(shí)間: 2023-08-09      來(lái)源: 本站

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導(dǎo)讀


2023年7月,康復(fù)大學(xué)青島醫(yī)院(青島市市立醫(yī)院)的韓偉教授團(tuán)隊(duì)在International Journal of Infectious DiseasesIF=8.4雜志發(fā)表一篇吉拉爾迪嗜銅菌在COVID-19 康復(fù)期患者中引起感染的病例報(bào)道,探討mNGS技術(shù)在快速診斷罕見病原體感染中的臨床價(jià)值。

/ 研究背景 /

吉拉爾迪嗜銅菌(Cupriavidus gilardii是一種需氧革蘭氏陰性桿菌,最早以美國(guó)著名微生物學(xué)家G.L.Gilardii命名。其特征是周生鞭毛,不能發(fā)酵葡萄糖,是一種分布廣泛的環(huán)境生物。目前已從血液、咽喉、糞便和膿腫標(biāo)本中零星分離出來(lái)。先前的報(bào)告將C.gilardii 描述為一種低致病性的微生物,主要可引起機(jī)會(huì)性感染,并對(duì)頭孢吡肟、左氧氟沙星等多種抗菌藥物表現(xiàn)出敏感性。

迄今為止,僅有5例由C.gilardii 引起的臨床感染病例被報(bào)道。其中,3例患者存在基礎(chǔ)免疫抑制(急性淋巴細(xì)胞白血病、再生障礙性貧血和腎移植受者),4例患者接受了侵入性操作。然而,吉拉爾迪嗜銅菌的臨床意義仍不明確。


/ 病例介紹 /

男,78歲,因呼吸困難和肢體水腫住院。

患者有多年高血壓和冠心病病史;于13年前接受過心臟搭橋手術(shù);4年前接受根治性前列腺切除術(shù),術(shù)后未接受任何放療或化療。

患者于1月前因COVID-19肺炎住院,在皮質(zhì)類固醇、無(wú)創(chuàng)呼吸機(jī)輔助通氣和抗生素治療等治療后,CT復(fù)查顯示感染消退后出院。但出院后3d,患者出現(xiàn)進(jìn)行性呼吸困難和肢體水腫,3d后再次入院。


入院診斷和治療

患者入院時(shí)實(shí)驗(yàn)室檢查:白細(xì)胞總數(shù) 7.72*109/L,其中淋巴細(xì)胞(T細(xì)胞淋巴瘤53.88%,分化簇[CD4+] 47.03%, [CD8+] 11.95%)2.8%,單核細(xì)胞 1.2%,中性粒細(xì)胞 96%,血紅蛋白 171g/l,血小板 77×109/l,C反應(yīng)蛋白 154 mg/l。動(dòng)脈血氧分壓為80.8 mm Hg。( 1、3)-β-葡聚糖含量 242.21pg/ml。其他實(shí)驗(yàn)室指標(biāo)均在正常范圍內(nèi)。但CT顯示雙肺感染,病灶增大。


HD1(入院第1天) 根據(jù)血常規(guī)和CT檢查結(jié)果,給予哌拉西林-他唑巴坦( 4.5g/8h)和伏立康唑(0.2g/2h)靜脈注射治療。


進(jìn)一步檢查和治療

HD4  對(duì)患者進(jìn)行支氣管鏡及肺泡灌洗術(shù),并同時(shí)送檢肺泡灌洗液和外周血兩份樣本進(jìn)行mNGS檢測(cè)。


HD6  mNGS結(jié)果回報(bào)雙樣本中均檢出C.gilardii 和煙曲霉,其中C.gilardii 序列數(shù)251485和175條,覆蓋度分別為85.42%和0.30%(圖1)。由于目前尚無(wú)針對(duì)C.gilardii 感染的治療指南,參考C.gilardii 感染的相關(guān)病例報(bào)道后停用哌拉西林-他唑巴坦,改用靜脈注射亞胺培南/西司他丁( 0.5g/6h )和米卡芬凈(0.1g/1d)進(jìn)行抗菌治療,口服甲氧芐啶-磺胺甲惡唑( 0.24g~1.2g/8 h )。

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圖1 BALF和外周血樣本中C.gilardii的覆蓋圖


HD7  院內(nèi)肺泡灌洗液培養(yǎng)結(jié)果為貪銅菌屬和煙曲霉陽(yáng)性,血培養(yǎng)結(jié)果為陰性。


HD8  患者血氧飽和度進(jìn)一步惡化,行氣管插管和機(jī)械通氣。血常規(guī)示:白細(xì)胞 7.95×109/l (4.8%的淋巴細(xì)胞, 1.4%的單核細(xì)胞和93.7%的中性粒細(xì)胞),CRP 290.5 mg/l,PCT 16.62ng/ml,提示患者可能存在嚴(yán)重感染。


HD10  隨訪X線顯示肺部炎癥加重。


轉(zhuǎn)歸和預(yù)后

HD12  患者病情持續(xù)惡化,因重癥肺炎和膿毒癥引起的多器官功能衰竭而死亡。

總結(jié)


1.  吉拉爾迪嗜銅菌是一種需氧革蘭陰性桿菌,鮮少引起感染,可機(jī)會(huì)性地感染免疫功能低下的患者,其臨床意義仍需進(jìn)一步探究。


2.  本研究首次報(bào)道了在 COVID-19 和皮質(zhì)類固醇使用后由吉拉爾迪嗜銅菌引起的肺部感染和嚴(yán)重膿毒癥的病例,并首次從肺泡灌洗液中分離出該致病菌。但因患者感染嚴(yán)重預(yù)后不良,無(wú)法評(píng)估所選抗生素方案的有效性。


3.  mNGS可進(jìn)行快速全面的病原體篩查,有助于罕見菌感染的診斷,為其治療提供臨床經(jīng)驗(yàn)。 

參考文獻(xiàn):

Fang X, Lu K, Sun S, Zhang H, Yu X, Han W. Infection caused by Cupriavidus gilardii in a convalescent COVID-19 patient [published online ahead of print, 2023 Jul 20]. Int J Infect Dis. 2023;134:287-289. doi:10.1016/j.ijid.2023.07.015

編譯:青木   審核:佳   排版:阿心

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